为深化产教融合，培养高层次应用型人才，上海交通大学与南湖实验室签订专业学位硕士研究生联合培养协议，共同建设“上海交通大学-南湖实验室”联培基地（以下简称“联培基地”）。联培基地设在南湖实验室，坐落于南湖区湘家荡科创湖区，占地400亩，总建筑面积18.5万㎡，分两期实施。一期工程项目规划用地150亩，总建筑面积8.1万㎡，总投资20亿元，过渡场地位于湘湖畔柳庄、绿萝庄、东庄和木兰庄，占地面积2.5万㎡。
南湖实验室由浙江省嘉兴市人民政府举办,北京大数据先进技术研究院提供科研支撑，是双方合作共建的高能级科研平台、浙江省首批新型研发机构、嘉兴市登记类事业单位法人。南湖实验室聚焦生命健康与信息技术两大领域重点布局，设立由6名院士领衔的人工智能芯片与系统、大数据技术、数智技术、可定义射频芯片与系统、数字生命和智能医学、先进生物制造六个研究中心。南湖实验室立足前沿科技研究和创新，充分利用共建单位在科研项目来源、领军科学家资源等方面的优势，开展基础研究和应用基础研究。目前，南湖实验室汇聚了以全职、双聘、兼职、派驻、轮驻等多元形式的各类人才224位，博士以上学历占比超过55%。
南湖实验室将充分利用高校人才培养和科研院所技术创新优势，与上海交大电子信息与电气工程学院计算机系、软件学院、微纳电子学系，船舶海洋与建筑工程学院联合培养电子信息、土木水利等专业的专业学位硕士研究生，以满足行业对高层次应用技术型人才的紧缺需求。